Untersuchungen zur Epidemiologie von Klebsiella pneumoniae auf einer herzchirurgischen Intensivstation mittels Massenspektrometrie
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Philipps-Universität Marburg
Abstract
In dieser Arbeit wurde die Frage untersucht, ob es möglich ist, mithilfe der MALDI-TOF Massenspektrometrie epidemiologische Zusammenhänge von Klebsiella pneumoniae Isolaten und deren Abstammungsbeziehungen erkennen zu können. Die analysierten Isolate (n = 56) entstammten der routinemäßigen Testung von intensivmedizinisch betreuten Patienten in einem Krankenhaus in Deutschland. Damit konzentrierte sich diese Untersuchung auf die alltägliche Epidemiologie dieser Bakterienspezies über einen Zeitraum von eineinhalb Jahren. Mittels MALDI-TOF, softwaregestützter Datenverarbeitung und Clusteranalyse konnten 12 MALDI Typen von K. pneumoniae differenziert werden. Die Betrachtung des zeitlichen Auftretens dieser Typen ließ vermuten, dass es sich hierbei um sehr begrenzte und zeitlich kurzfristige Übertragungsereignisse handelte, sog. „Mini-Cluster“. Weiterhin erfolgte eine vergleichende Analyse einer 36 Isolate umfassenden Stichprobe mit Typisierungsergebnissen einer Referenzmethode (Pulsfeldgelelektrophorese, PFGE). Mit einem Adjusted Rand Index (ARI) von 0,761 zeigte sich eine gute Übereinstimmung der beiden Typisierungsmethoden.
In this thesis, the question of whether it is possible to detect epidemiological relationships of K. pneumoniae isolates using MALDI-TOF mass spectrometry was investigated. All of the 56 analyzed Klebsiella pneumoniae isolates came from routine testing of patients receiving intensive care at a hospital in Germany. The study focused on the day-to-day epidemiology of this bacterial species over a period of 18 months. Using MALDI-TOF, software-assisted data processing and cluster analysis, 12 MALDI types of K. pneumoniae could be differentiated. Consideration of the temporal occurrence suggested that many of the K. pneumoniae types can be seen as limited and temporally short-term transmission events, so-called "mini-clusters". Furthermore, a comparative analysis of a sample of 36 isolates with typing results of a reference method (pulsed field gel electrophoresis (PFGE)) was performed. With an Adjusted Rand Index (ARI) of 0.761, a good agreement between the two typing methods was found.
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